Die tatsächliche Geschichte der Giraffe Zarafa, die dem französischen König 1827 geschenkt wurde, ist Inspirationsquelle für einen fantasiereichen Animationsfilm, der das Ereignis als eigenständiges Märchen anlegt.
Die Regisseurin Icíar Bollaín erzählt von einem europäischen Filmteam, das in Bolivien einen Film über Kolumbus dreht, und dort von der Realität eingeholt wird.
Nachdem es die New Yorker Zootiere im ersten Teil auf die Titel gebende Insel verschlagen hat, versuchen sie nun in einem alten Flugzeug den Heimweg anzutreten. Doch stattdessen stranden sie in Afrika.